Panova flauta je jedným z najstarších hudobných nástrojov.  Jej pôvod siaha až do samých počiatkov civilizácie. Už v dobe kamennej bola vyrábaná z rákosia, trstiny a bambusu. Názov "Panova" pochádza zo starovekého Grécka, z gréckej mytológie. Podľa povestí žil v Arkádii istý boh Pan, ochranca pastierov a stád, ktorý sa zamiloval do krásnej nymfy Syrinx. Keďže Pan bol napoly človek a napoly cap, nie je divu, že pôvabná nymfa jeho lásku neopätovala. Keď sa Panov záujem stal pre nymfu neznesiteľný, začala pred ním utekať. Pan ju však stále prenasledoval, až sa dostali k rieke. 
Syrinx už nemala kam utiecť, a tak sa na vlastnú žiadosť nechala od vládcu všetkých bohov Dia premeniť na trstinu. 
Panova láska k Syrinx bola však natoľko silná, že si z tohto tŕstia urobil píšťalu a po večeroch na nej vyhrával smutné piesne. 
V dnešnej dobe sa Panova flauta vyrába z dreva, bambusu ale môže byť aj zo skla alebo z plastu a kovu.
Býva označovaná aj ako Panova píšťala, avšak toto označenie je nesprávne, pretože ju tvoria len pospájané rezonančné rúrky bez jadra.